Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TTL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms