Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms