Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TQQ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TQQ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms