Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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