Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrc2cQ3TLH4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms