Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam107bQ3TGF2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam107bQ3TGF2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms