Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms