Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccbe1Q3MI99 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms