Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms