Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms