Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rpusd3Q14AI6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rpusd3Q14AI6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd3Q14AI6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd3Q14AI6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpusd3Q14AI6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms