Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms