Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms