Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrriq1Q0P5X1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrriq1Q0P5X1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms