Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc21bQ0HA38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms