Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms