Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms