Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col17a1Q07563 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col17a1Q07563 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Col17a1Q07563 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col17a1Q07563 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms