Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms