Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdx4Q07424 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms