Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nfe2Q07279 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms