Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox4Q06831 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms