Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms