Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms