Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms