Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprgQ05909 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms