Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rcn1Q05186 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms