Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms