Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms