Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms