Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms