Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms