Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms