Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms