Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms