Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms