Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aplp1Q03157 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aplp1Q03157 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms