Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms