Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epha4Q03137 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms