Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nucb1Q02819 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nucb1Q02819 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms