Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms