Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms