Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GscQ02591 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GscQ02591 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GscQ02591 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GscQ02591 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GscQ02591 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GscQ02591 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GscQ02591 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms