Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlh1Q02576 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms