Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uba1Q02053 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms