Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RykQ01887 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RykQ01887 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RykQ01887 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RykQ01887 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RykQ01887 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RykQ01887 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RykQ01887 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms