Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VcpQ01853 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms