Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms