Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms