Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms